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基于ITS條形碼規(guī)范桑黃孔菌屬藥用真菌的物種鑒定

發(fā)布時(shí)間:2021-04-16

大型真菌中為數(shù)眾多的藥用菌,是我國(guó)傳統(tǒng)中醫(yī)藥的重要組成部分(Wu et al. 2019)。其中,桑黃孔菌屬真菌Sanghuangporus spp. 在我國(guó)有2000多年的藥用歷史?,F(xiàn)代科學(xué)研究表明桑黃具有良好的抗腫瘤、抗氧化、抗炎、免疫調(diào)節(jié)和降糖功效(Cheng et al. 2020,Zhou et al. 2021),目前已有多個(gè)省區(qū)發(fā)布了桑黃的地方性炮制規(guī)范。桑黃不僅在東亞地區(qū)大受歡迎,而且也引起了歐洲真菌化學(xué)家和藥理學(xué)家的研究興趣(Chepkirui et al. 2018,Cheng et al. 2019)。

目前,阻礙有效利用桑黃資源的因素中,首要因素是物種名稱(chēng)的誤用(Zhou et al. 2021)。一方面是由于在桑黃孔菌屬建立之前,沒(méi)有一個(gè)合理的分類(lèi)系統(tǒng)來(lái)承載桑黃類(lèi)群的不同種類(lèi),因此Phellinus linteus等多個(gè)真菌學(xué)名被誤用于桑黃孔菌屬真菌(Zhou et al. 2016);另一方面原因是在使用真菌條形碼ITS基因進(jìn)行物種鑒定時(shí),錯(cuò)信公共數(shù)據(jù)庫(kù)中標(biāo)注不準(zhǔn)確的物種名稱(chēng),并據(jù)此將新提交的ITS序列同樣標(biāo)注為不準(zhǔn)確的物種名稱(chēng),導(dǎo)致后續(xù)積累了越來(lái)越多的錯(cuò)誤。

準(zhǔn)確的物種鑒定是大型真菌藥用功能研究和產(chǎn)業(yè)發(fā)展的先決條件(Zhou 2020)。為解決桑黃物種名稱(chēng)誤用這一問(wèn)題,首先從GenBank中搜索與桑黃孔菌屬相關(guān)的全部ITS序列,結(jié)合本研究新測(cè)序獲得的ITS序列一并分析,發(fā)現(xiàn)有過(guò)半數(shù)ITS序列的名稱(chēng)標(biāo)注有誤(圖1)。進(jìn)一步選取其中由真菌分類(lèi)學(xué)家提交的ITS序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,并結(jié)合形態(tài)特征,發(fā)表了桑黃孔菌屬一新種擬鮑姆桑黃S. subbaumii(圖2),界定桑黃孔菌屬共有14個(gè)種類(lèi)【注:本文成稿后,吳聲華博士團(tuán)隊(duì)發(fā)表了桑黃孔菌屬的另一個(gè)新種(Wu et al. 2020),因此目前該屬共有15個(gè)種類(lèi)】,給出每個(gè)種類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)的分類(lèi)學(xué)信息和可靠的ITS基因參考序列,提供了種間和種內(nèi)的ITS序列差異范圍,為以BLAST方法進(jìn)行桑黃孔菌屬真菌物種鑒定提供了切實(shí)可行的操作標(biāo)準(zhǔn)。接下來(lái)將與公共數(shù)據(jù)庫(kù)負(fù)責(zé)人聯(lián)系,建議據(jù)此修改桑黃孔菌屬真菌ITS序列標(biāo)注的物種名稱(chēng)。

圖片關(guān)鍵詞

1基于ITS序列的桑黃孔菌屬真菌系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系(綠色字體表示物種名稱(chēng)錯(cuò)誤標(biāo)記的標(biāo)本來(lái)源序列,紅色字體表示物種名稱(chēng)錯(cuò)誤標(biāo)記的菌株來(lái)源序列)

圖片關(guān)鍵詞

2擬鮑姆桑黃子實(shí)體原位照片(a. 主模式標(biāo)本, b. 副模式標(biāo)本;比例尺為2 cm

相關(guān)研究結(jié)果以Addressing widespread misidentifications of traditional medicinal mushrooms in Sanghuangporus (Basidiomycota) through ITS barcoding and designation of reference sequences為題,于2021415日發(fā)表于國(guó)際菌物學(xué)會(huì)官方雜志IMA Fungus期刊(點(diǎn)擊文末閱讀原文獲取全文)。中國(guó)科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士生沈珊、助理研究員劉世良為共同第一作者,周麗偉為通訊作者,助理研究員姜霽航也參與了研究工作。本研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)、中國(guó)科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)和中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略生物資源計(jì)劃的資助。

 

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Cheng T, Chepkirui C, Decock C, et al. 2019. Sesquiterpenes from an eastern African medicinal mushroom belonging to the genus Sanghuangporus. Journal of Natural Products 82:1283–1291.

Chepkirui C, Cheng T, Matasyoh J, et al. 2018. An unprecedented spiro [Furan-2,1?-indene]-3-one derivative and other nematicidal and antimicrobial metabolites from Sanghuangporus sp. (Hymenochaetaceae, Basidiomycota) collected in Kenya. Phytochemistry Letters 25:141–146.

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撰文:周麗偉

編輯:王雪蔚

 


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